MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS102

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006376	A	7	7	22	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006376	TGTT	2	8	73	80	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006376	AAAAG	2	10	107	116	80 %	0 %	20 %	0 %	54307233
4	NC_006376	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	54307233
5	NC_006376	CAAA	2	8	168	175	75 %	0 %	0 %	25 %	54307233
6	NC_006376	A	6	6	255	260	100 %	0 %	0 %	0 %	54307233
7	NC_006376	TTAT	2	8	274	281	25 %	75 %	0 %	0 %	54307233
8	NC_006376	CAG	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
9	NC_006376	TTG	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307233
10	NC_006376	AGCA	2	8	450	457	50 %	0 %	25 %	25 %	54307233
11	NC_006376	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
12	NC_006376	ATG	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307233
13	NC_006376	TGAT	2	8	550	557	25 %	50 %	25 %	0 %	54307233
14	NC_006376	ATTA	2	8	757	764	50 %	50 %	0 %	0 %	54307233
15	NC_006376	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006376	GTT	2	6	862	867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006376	GT	3	6	868	873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006376	AT	3	6	901	906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006376	CTA	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006376	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006376	TCA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
22	NC_006376	TTC	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
23	NC_006376	CAA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307234
24	NC_006376	TCA	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
25	NC_006376	TAA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307234
26	NC_006376	A	8	8	1133	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	54307234
27	NC_006376	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307234
28	NC_006376	CT	3	6	1162	1167	0 %	50 %	0 %	50 %	54307234
29	NC_006376	CAAT	2	8	1201	1208	50 %	25 %	0 %	25 %	54307234
30	NC_006376	TTC	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
31	NC_006376	TTC	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
32	NC_006376	TAATTG	2	12	1298	1309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54307234
33	NC_006376	T	6	6	1313	1318	0 %	100 %	0 %	0 %	54307234
34	NC_006376	A	6	6	1334	1339	100 %	0 %	0 %	0 %	54307234
35	NC_006376	ACC	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307234
36	NC_006376	TCC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_006376	TATTT	2	10	1420	1429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006376	T	6	6	1456	1461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006376	ATT	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006376	A	6	6	1534	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006376	T	6	6	1551	1556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006376	A	6	6	1586	1591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006376	AATT	2	8	1596	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006376	T	6	6	1615	1620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006376	TTTTG	2	10	1647	1656	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006376	CAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006376	CTGT	2	8	1719	1726	0 %	50 %	25 %	25 %	54307235
48	NC_006376	TGA	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307235
49	NC_006376	GGC	2	6	1868	1873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54307235
50	NC_006376	T	6	6	1972	1977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006376	TGT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006376	AAAT	2	8	1990	1997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006376	G	6	6	2010	2015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006376	TAC	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006376	C	6	6	2047	2052	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_006376	A	9	9	2124	2132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006376	CAA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006376	CAA	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006376	A	7	7	2158	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006376	A	7	7	2189	2195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006376	A	7	7	2254	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006376	AGA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.